Erstmals tritt die Erkrankung zumeist bei jungen Menschen zwischen dem 20. und 30. Lebensjahr auf. Ein zweiter, aber wesentlich geringerer Erkrankungsgipfel ist nach dem 60. Lebensjahr zu beobachten. Prinzipiell kann Morbus Crohn aber in jedem Lebensalter auftreten. Weibliches und männliches Geschlecht sind von chronisch entzündlichen Darmerkrankungen etwa gleich häufig betroffen. Morbus Crohn kommt bei Frauen allerdings etwas häufiger vor.
Statistischen Erhebungen zufolge besteht in Europa für Morbus Crohn ein Nord-Süd-Gefälle: So ist die Erkrankungsrate etwa in Skandinavien um 80 Prozent höher als in Griechenland oder Portugal. In Österreich leiden Schätzungen zufolge rund 3.500 Menschen an Morbus Crohn.
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